Graphic ConverterがVer4.9.3からSD10のファイルを読み込み＆現像可能になったので、現像を試していた所、撮像素子の画素欠けらしき現象を発見しました。
下の画像がGraphic Converterで現像したものをトリミングしたものです。
いろいろ確認したところ、以下の事が分かりました。

1.この現象はGraphic Converterで現像（読み込み）した時に出てきており、Photoshop CS CameraRAWプラグインやSIGMA PhotoPro、SD10本体の背面液晶のプレビューでは見つからない。
2.画素欠けらしきものの位置はすべて同じ場所に出てくる。
3.以前の機体（今の機体はちょっと問題があって2機目）ではこの現象は見つからず、今の機体で撮影したすべての画像に見られる。

やはり今の機体に何か問題あるのか、保証期間中に解決したかったのでシグマさんに相談したところ、Graphic Converterでしか見られない現象なのでどうなるか分からないが、確認のため送ってほしいとの事。
早速確認していただいたのですが、やっぱりGraphic Converterでは検知できるのですが、各部点検結果カメラは異常なしとのことでした。
ちょっとすっきりしない部分がありますが、SIGMA PhotoProでは出てこない現象なので（補間されてる？）気にしない事にしました。

ちなみに、頼んでいたかった撮像素子のクリーニングを一緒にやってくれていました。
シグマさんありがとう。